Στο τμήμα φλογέρας τα παιδιά σε μικρές ομάδες μαθαίνουν φλογέρα. Το όργανο είναι δικό τους καθώς και το βιβλίο που πρέπει να αγοράσουν, τα μαθήματα γίνονται 2 φορές την εβδομάδα, και μία ώρα παρουσίας στην Φιλαρμονική ορχήστρα. Σκοπός είναι να γνωρίσουν την Φιλαρμονική ορχήστρα και τα όργανα που την αποτελούν , για να μπορέσουν να επιλέξουν το όργανο που τους ταιριάζει .Το τμήμα φλογέρας έχει σαν στόχο την προετοιμασία των παιδιών στα πνευστά όργανα έτσι ώστε να μπορέσουν να μεταπηδήσουν ομαλά στο όργανο της αρεσκείας τους.
